Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCLMP48507 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCLMP48507 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCLMP48507 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCLMP48507 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms