Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX5P48382 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX5P48382 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX5P48382 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX5P48382 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX5P48382 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms