Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms