Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms