Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XBP1P17861 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XBP1P17861 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms