Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA2P17301 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA2P17301 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA2P17301 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA2P17301 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms