Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP3P12645 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP3P12645 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms