Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-HP01893 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms