Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F6O75461 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F6O75461 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F6O75461 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F6O75461 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F6O75461 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F6O75461 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F6O75461 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms