Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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HOXA2O43364 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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HOXA2O43364 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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HOXA2O43364 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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HOXA2O43364 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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HOXA2O43364 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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