Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD28O15084 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms