Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM4A7MD48 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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