Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms