Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms