Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
WASHC2CQ9Y4E1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms