Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBNO2Q9Y2G9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms