Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KB2Q9UBS0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB2Q9UBS0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms