Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3AQ9NVI7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms