Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOMER3Q9NSC5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOMER3Q9NSC5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms