Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms