Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP1-5Q9BYS1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms