Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms