Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LARP6Q9BRS8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms