Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC7Q96M83 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms