Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms