Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E3Q969T4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E3Q969T4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms