Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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