Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARMIL3Q8ND23 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms