Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms