Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC80Q76M96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms