Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms