Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6CQ53S08 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms