Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms