Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms