Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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RPE65Q16518 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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RPE65Q16518 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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RPE65Q16518 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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