Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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