Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSHL1Q14406 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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