Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3FQ13275 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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