Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 ANXA6-203ENST00000517486 562 ntTSL 511.24□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 411.23□□□□□ -0.611e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 410.24□□□□□ -0.771e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 49.44□□□□□ -0.91e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 A2M-206ENST00000495442 729 ntTSL 39.21□□□□□ -0.949e-12■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 GNL3-210ENST00000492349 729 ntTSL 26.83□□□□□ -1.323e-6■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 A2M-207ENST00000495709 509 ntTSL 24.29□□□□□ -1.729e-12■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 212.34□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.153e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.063e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.043e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.963e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)20.26■□□□□ 0.833e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 DHCR7-206ENST00000527316 1005 ntTSL 518.87■□□□□ 0.613e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RSPRY1-208ENST00000564435 743 ntTSL 518.74■□□□□ 0.593e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 PIGQ-210ENST00000476438 1775 ntTSL 218.63■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.563e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.563e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 PIGQ-216ENST00000634341 1046 nt18.28■□□□□ 0.523e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RSPRY1-206ENST00000562959 548 ntTSL 417.71■□□□□ 0.433e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 FASTK-206ENST00000465272 457 ntTSL 217.55■□□□□ 0.43e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RSPRY1-204ENST00000562439 692 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 TYMS-206ENST00000584122 534 ntTSL 416.87■□□□□ 0.293e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.253e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.253e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 AP5Z1-205ENST00000490487 917 ntTSL 315.54■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 PIGQ-214ENST00000540548 187 ntTSL 315.11■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.017e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 FAAP100-203ENST00000443656 3822 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 HGSNAT-203ENST00000519000 721 ntTSL 414.73□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.7□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL32P3-207ENST00000514355 2816 ntTSL 214.58□□□□□ -0.083e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MLXIP-202ENST00000366272 1682 ntTSL 314.36□□□□□ -0.113e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MLXIP-211ENST00000542417 513 ntTSL 214.23□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 DHCR7-210ENST00000533800 837 ntTSL 314.19□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RSPRY1-211ENST00000568505 654 ntTSL 514.05□□□□□ -0.163e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MBD6-206ENST00000548550 563 ntTSL 413.9□□□□□ -0.183e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.183e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-203ENST00000441123 5380 ntTSL 1 (best)13.83□□□□□ -0.23e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SGSM3-206ENST00000467915 769 ntTSL 313.6□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 DHCR7-203ENST00000525137 996 ntTSL 313.34□□□□□ -0.273e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 TRIM66-207ENST00000530502 858 ntTSL 313.12□□□□□ -0.313e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.313e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 512.78□□□□□ -0.363e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SYTL1-202ENST00000473280 312 ntTSL 312.54□□□□□ -0.43e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 FAAP100-207ENST00000545865 689 ntTSL 212.41□□□□□ -0.423e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-206ENST00000449261 4816 ntTSL 512.3□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 PRKAB1-202ENST00000537057 1510 nt12.22□□□□□ -0.453e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 DHCR7-212ENST00000534795 979 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.463e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 WDR90-205ENST00000546896 396 ntTSL 312.14□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SIK3-209ENST00000480222 665 ntTSL 312.1□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 WDR90-220ENST00000551100 623 ntTSL 211.99□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.537e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SGSM3-208ENST00000470518 854 ntTSL 311.61□□□□□ -0.553e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 HGSNAT-208ENST00000522082 560 ntTSL 411.18□□□□□ -0.623e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-209ENST00000532330 4077 ntTSL 511□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 210.95□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RSPRY1-203ENST00000561641 579 ntTSL 510.93□□□□□ -0.663e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-204ENST00000441730 3329 ntTSL 510.45□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 HGSNAT-210ENST00000524016 757 ntTSL 410.25□□□□□ -0.773e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RSPRY1-201ENST00000394420 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.793e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SLC7A6-204ENST00000562863 419 ntTSL 510.1□□□□□ -0.793e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-202ENST00000317168 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.823e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL19-201ENST00000225430 732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL19-205ENST00000579374 690 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-217ENST00000532011 569 ntTSL 49.68□□□□□ -0.863e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.883e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL32P3-208ENST00000515866 702 ntTSL 39.01□□□□□ -0.973e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 DOCK5-203ENST00000444569 5335 ntTSL 59.01□□□□□ -0.973e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 PRKAB1-207ENST00000542698 4019 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.973e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-207ENST00000486689 1798 ntTSL 58.69□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)8.42□□□□□ -1.063e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 GTPBP4-204ENST00000491261 373 ntTSL 28.36□□□□□ -1.073e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-213ENST00000527593 580 ntTSL 48.2□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.143e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.153e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 RPL32P3-202ENST00000499631 593 ntTSL 47.58□□□□□ -1.23e-10■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-215ENST00000530461 548 ntTSL 47.47□□□□□ -1.213e-7■■■■□ 23.5
SF3A3Q12874 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.243e-7■■■■□ 23.5
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