Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD47Q08722 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms