Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms