Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms