Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms