Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GBX2P52951 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBX2P52951 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX2P52951 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms