Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms