Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN2P35609 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms