Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms