Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLD1P28340 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLD1P28340 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLD1P28340 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms