Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIG1P18858 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIG1P18858 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIG1P18858 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIG1P18858 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms