Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB3P16520 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB3P16520 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB3P16520 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB3P16520 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB3P16520 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB3P16520 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms